Ukoliko dolazite avionom, vjerojatno ćete sletjeti na najveći hrvatski međunarodni aerodrom, koji je u Zagrebu. Pošto je aerodrom izvan centra grada Zagreba, potreban je transfer autobusom ili taxi službom do samog grada gdje se nalazi najbliža željeznička i autobusna stanica pa možete izravnim linijama putovati za Čakovec, odnosno Međimurje. Više informacija na http://www.zagreb-airport.hr/Kako-do-Zracne-luke-g29.aspx

Zbog blizine susjednih država, bitno je spomenuti blizinu zračne luke Maribor (70 km) kao i zračne luke u Budimpešti koja je udaljena od Čakovca 275 km vožnje po autocesti. 

U Međimurju se nalazi i sportski „Aerodrom Čakovec“ koji je smješten u Pribislavcu (nedaleko Čakovca). Aerodrom Čakovec spada u kategoriju aerodroma namijenjenih za povremeni zračni prijevoz, školovanje i sport. Na aerodromu trenutno ne postoje terminali za prihvat i otpremu putnika i robe. Travnata uzletno-sletna staza duga je 1.100 m, široka 42 m, proteže se u smjeru 210°-030° i nema ugrađena svjetla na noćno letenje. Na aerodrom mogu slijetati avioni mase do 5.700 kg, iako bi uz podizanje vatrogasne kategorije mogli slijetati i veći avioni.

U neposrednoj blizini Međimurja, u Varaždinu također je dostupan aerodrom „Varaždin Airport“.  Aerodrom je pogodan za prihvat helikoptera te jednomotornih i dvomotornih klipnih zrakoplova generalnog zrakoplovstva, te također mogu slijetati i mlazni poslovni zrakoplovi svih kategorija te srednji putnički turbo-prop ili mlazni zrakoplovi kakav je primjerice Q400.